Colony, bir biyoteknoloji konferansı sırasında hızla mutasyona uğrayan ölümcül bir virüsün serbest kalmasıyla başlayan korku ve gerilim hikâyesidir. Profesör Se-jeong, yetkililerin tesisi karantinaya almasıyla kendisini içeride mahsur kalmış küçük bir grup hayatta kalanla birlikte bulur. Dış dünyayla bağlantıları kesilen grup, virüsün bulaştığı insanların korkunç dönüşümlere uğradığı bir ortamda hayatta kalmak için mücadele eder. Kaçış yolları tükenirken Se-jeong, hem virüsün ardındaki gerçeği ortaya çıkarmak hem de hayatta kalanları korumak için zamana karşı yarışır.